Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2798082 2798108 27 76 [0] [0] 54 dinF/yjbJ DNA‑damage‑inducible SOS response protein/predicted stress response protein

AAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTC  >  minE/2798024‑2798081
                                                         |
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACTTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1069905/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:576395/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:71216/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:706334/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:65548/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:632685/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:626722/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:60801/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:589764/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:587928/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:576888/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:738537/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:525023/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:516267/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:506688/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:465468/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:444449/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1004728/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:409477/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:882627/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:998269/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:948984/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:945705/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:935327/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:906491/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:905794/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:904301/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:898692/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:730607/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:875817/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:862069/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:850950/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:821824/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:761941/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:756989/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:746432/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:429427/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1092848/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:155574/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:147537/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:144686/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:121907/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1178971/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1170090/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1164709/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1158409/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1110930/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:173240/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1082192/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1068663/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1046977/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1040242/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1035280/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1010247/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1008522/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1007764/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:378582/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:351526/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:349144/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:328301/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:321269/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:250728/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:2503/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:399470/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:373194/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:228741/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:224106/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:219704/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:206073/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:192752/58‑1 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:186070/58‑1 (MQ=255)
 aGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:582662/57‑1 (MQ=255)
     aaaTTGCTGACTACACTTAATCTGACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:582006/53‑1 (MQ=255)
           cTGACTTCACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:678356/47‑1 (MQ=255)
             gACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:1120251/45‑1 (MQ=255)
                 acacTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACtctc  <  1:489522/41‑1 (MQ=255)
                                                         |
AAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTC  >  minE/2798024‑2798081

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: