Missing coverage evidence...
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AATAAGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACACAGCAG  >  minE/2831043‑2831103                                                             | aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCATAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:815461/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:532904/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:985855/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:979344/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:972085/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:927208/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:92208/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:878251/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:848757/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:805690/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:805257/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:751358/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:713913/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:1008041/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:436415/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:354772/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:282182/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:232780/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:191008/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:186964/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:1165449/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:1124281/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:1123972/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:1060938/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:1060590/1‑61 (MQ=255) aataaGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACAcagcag  >  1:104395/1‑61 (MQ=255)                                                             | AATAAGAGCGTCCAGATTGATCTCTAAAGCATGAATCACCAAAGTGCTCACCACACAGCAG  >  minE/2831043‑2831103

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑