Missing coverage evidence...
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AACGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGC  >  minE/2853529‑2853589                                                             | aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCTGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:378477/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:479712/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:984105/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:971480/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:89243/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:87448/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:843692/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:842267/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:756087/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:604596/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:598702/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:497149/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:495374/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:1006467/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:449642/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:44280/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:403930/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:398897/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:384186/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:276156/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:167356/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:142806/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:130425/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:125234/61‑1 (MQ=255) aaCGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:111162/61‑1 (MQ=255)                           tGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:696929/35‑1 (MQ=255)                           tGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGc  <  1:849192/35‑1 (MQ=255)                                                             | AACGCTCGAATTTTTAAAACAGTGGGTGCCTGCGGGAAAATCGCCGATTTGCGGTAACAGC  >  minE/2853529‑2853589

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑