Missing coverage evidence...
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GACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGC  >  minE/2862394‑2862455                                                              | gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:452235/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:890939/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:857793/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:818702/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:747627/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:747049/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:707230/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:666034/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:6481/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:481226/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:480964/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:467342/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:454996/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:1048311/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:428429/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:415652/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:359220/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:346256/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:332413/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:311036/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:29110/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:27958/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:1201023/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:1157010/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:1066920/62‑1 (MQ=255) gACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:1057319/62‑1 (MQ=255)  aCAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:84010/61‑1 (MQ=255)  aCAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:846268/61‑1 (MQ=255)       gATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGc  <  1:1089339/56‑1 (MQ=255)                                                              | GACAAAGATATGGAAGACCTCCAGGAGTTTGAATCTCTGGTCTCTTCCGCCGGTGTCGAAGC  >  minE/2862394‑2862455

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑