Missing coverage evidence...
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CCAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGCTCT  >  minE/2872806‑2872867                                                              | cctgAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:856765/59‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:744090/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:416950/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:526741/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:57015/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:592776/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:621727/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:621991/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:656353/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:688430/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:694177/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:734039/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:1049228/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:780761/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:830354/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:925346/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:938605/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:940055/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:994261/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:995341/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:997847/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:256204/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:170310/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:173108/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:1194194/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:189745/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:194875/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:207063/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:246945/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:1170608/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:296450/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:3028/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:320341/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:357863/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:1123337/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:1116070/62‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:360975/62‑1 (MQ=255)  cAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:1008519/61‑1 (MQ=255)  cAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:480178/61‑1 (MQ=255)  cAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:445595/61‑1 (MQ=255)  cAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGcact  <  1:187314/61‑1 (MQ=255)   aGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:1084937/60‑1 (MQ=255)       gggCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:494319/56‑1 (MQ=255)                     cTGAACATAGATACCTCATCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:150052/42‑1 (MQ=255)                      tGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:870957/41‑1 (MQ=255)                         aCATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGctct  <  1:624014/38‑1 (MQ=255)                                                              | CCAGAAGGGCTAAAACACGACTGAACATAGATACCTCCTCGACGGCTGACTTTGTGTGCTCT  >  minE/2872806‑2872867

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑