Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2978603	2978612	10	53 [0]	[0] 17	slt	lytic murein transglycosylase, soluble

CTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTGG  >  minE/2978543‑2978602                                                            | cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:679640/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:436424/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:45482/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:458794/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:508228/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:510570/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:516273/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:51878/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:586543/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:587196/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:637863/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:651303/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:664592/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:666781/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:430484/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:699520/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:714931/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:718475/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:72940/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:776517/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:785486/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:788248/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:820398/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:850470/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:858823/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:858842/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:922988/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:152072/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1082388/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:108549/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:108567/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1086129/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1086963/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1090613/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1100169/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1108449/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1115423/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1132625/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:135759/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:150982/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:1077338/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:170391/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:171426/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:263151/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:282503/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:311886/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:323370/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:344623/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:367710/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:379450/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:387676/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:387802/1‑60 (MQ=255) cTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  >  1:413869/1‑60 (MQ=255)                                                            | CTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTGG  >  minE/2978543‑2978602

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑