Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2981870	2981873	4	60 [0]	[0] 2	creA	conserved hypothetical protein

ATATGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCA  >  minE/2981809‑2981869                                                             | atatGAAATACAAGCATTTGTTCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:649357/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:84879/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:528718/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1042765/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:587828/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:631431/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:65585/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:675748/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:707068/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:785415/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:798469/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:813553/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:825401/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:84257/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:531473/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:851368/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:870807/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:882849/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:896539/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:89816/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:90053/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:911642/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:938163/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:946521/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:955648/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:985087/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:987495/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:997646/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:196259/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:10736/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1088371/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1094015/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1118840/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1125702/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1127198/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1129346/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:115245/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1194954/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1194977/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:149549/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:161603/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:166654/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:495279/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:317289/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:488036/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:444318/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:427542/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:395013/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:343153/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:341441/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:206925/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:286294/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:270686/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:254413/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:234784/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGCGGCCATTGGCTCa  >  1:971541/1‑61 (MQ=255) atatGAAATACAAGCATTTGATCATGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:731391/1‑61 (MQ=255)  tatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:1161536/1‑60 (MQ=255)  tatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:577321/1‑60 (MQ=255)  tatGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCa  >  1:821427/1‑60 (MQ=255)                                                             | ATATGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCA  >  minE/2981809‑2981869

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑