Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	278469	278502	34	40 [0]	[0] 24	cyoB	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I

GCGCACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAT  >  minE/278407‑278468                                                              | gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:772219/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:483536/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:491439/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:543626/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:545090/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:571612/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:587100/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:595285/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:62800/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:657200/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:433072/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:780475/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:830476/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:831539/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:904158/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:909346/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:909670/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:945548/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:945784/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:982388/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:233159/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:1104285/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:110553/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:1109790/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:112448/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:1125155/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:1178472/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:124661/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:18672/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:232802/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:1012030/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:257713/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:311376/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:326801/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:327309/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:335786/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:377679/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:38823/1‑62 (MQ=255) gcgcACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGACATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:321549/1‑62 (MQ=255) gcacacaGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAt  >  1:323693/4‑62 (MQ=255)                                                              | GCGCACAGTGATGCCCAGGTAAATACTGGCATCTTGAACATGGTCATGCCCGGTGCGCGCAT  >  minE/278407‑278468

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑