Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	359375	359637	263	57 [0]	[0] 5	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

TCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAG  >  minE/359313‑359374                                                              | tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:591073/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:390032/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:408060/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:423376/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:426789/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:441945/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:484148/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:494418/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:49472/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:552100/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:557645/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:565231/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:571573/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:581394/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:388738/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:657270/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:665450/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:693563/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:70735/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:773441/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:815604/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:835720/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:870081/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:874240/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:952958/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:953245/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:962247/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:986782/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:193906/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1007293/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1009426/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1020184/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1039460/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1076863/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1081341/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1096077/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1122341/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1136967/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1152088/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1176532/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:129123/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:145327/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:191242/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:1000347/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:197075/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:197554/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:211353/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:250234/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:261893/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:274692/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:337461/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:354117/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:358014/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:36124/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:362059/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:381870/1‑62 (MQ=255) tCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAAAGATAGCTATTTTTTTAGTGAg  >  1:524397/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAG  >  minE/359313‑359374

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑