Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2573	2694	122	63 [0]	[0] 43	thrA	fused aspartokinase I and homoserine dehydrogenase I

TTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATG  >  minE/2522‑2572                                                   | ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGTGCTATg  <  1:368203/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:761407/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:553443/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:573912/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:588663/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:602217/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:632647/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:635600/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:640923/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:667786/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:689966/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:701950/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:703944/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:705586/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:715329/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:740941/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1026547/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:806006/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:809357/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:853142/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:857740/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:88145/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:881517/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:898707/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:913006/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:928955/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:929577/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:977640/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:978468/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:988329/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:992544/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:197285/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1002360/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1029684/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1057997/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1059851/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1071650/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1097324/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:1123065/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:129356/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:134515/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:166543/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:176338/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:195984/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:205539/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:242958/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:44858/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:416928/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:395605/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:389753/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:373198/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:366310/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:359847/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:305279/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:304509/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:269658/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:249674/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:21857/51‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCGCGGGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:531128/51‑1 (MQ=255)  tGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:891092/50‑1 (MQ=255)  tGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:622379/50‑1 (MQ=255)            gTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:147301/40‑1 (MQ=255)                 gAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATg  <  1:159969/35‑1 (MQ=255)                                                   | TTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATG  >  minE/2522‑2572

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑