Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	445519	445723	205	36 [0]	[0] 57	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

CCAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAT  >  minE/445459‑445518                                                            | ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGCCTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:925721/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:808028/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:514823/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:579468/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:63703/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:666997/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:699656/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:745675/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:765311/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:766664/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:484379/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:866013/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:878544/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:881518/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:882479/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:933499/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:948322/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:976940/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:20841/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:105424/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:1101718/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:1114658/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:1134267/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:1178134/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:1181146/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:1184007/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:141589/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:1023162/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:21586/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:234615/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:234740/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:264744/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:320521/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:372245/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:430618/1‑60 (MQ=255) ccAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAt  >  1:452873/1‑60 (MQ=255)                                                            | CCAGCATTTGCAGCGCGCTGCCGACTACTTCTTCCAGCGTTAACCACTCTTTCTTCAAAT  >  minE/445459‑445518

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑