Missing coverage evidence...
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TACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGG  >  minE/452145‑452188                                            | tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:662165/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:330237/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1048585/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:386081/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:416402/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:449245/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:488169/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:574863/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:655802/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:343886/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:789334/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:884560/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:92618/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:939067/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:944763/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:952617/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:96245/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:968243/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:15137/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:110111/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1125569/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1142260/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1146170/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1146397/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1160939/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:327562/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:155915/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:181336/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:198625/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:257256/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:263962/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:299417/44‑1 (MQ=255) tACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:306090/44‑1 (MQ=255)  acacCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1153353/43‑1 (MQ=255)  acacCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:448527/43‑1 (MQ=255)  acacCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:447083/43‑1 (MQ=255)  acacCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:1109781/43‑1 (MQ=255)   caccacGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAgg  <  1:936146/42‑1 (MQ=255)                                            | TACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGG  >  minE/452145‑452188

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑