Missing coverage evidence...
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CGCGCGAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGAA  >  minE/458156‑458215                                                            | cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:822899/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:484748/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:504412/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:510542/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:544016/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:610455/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:620979/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:656105/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:685524/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:696252/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:786776/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:813323/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:482675/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:856566/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:864565/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:903749/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:911335/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:946882/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:951577/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:951977/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:955015/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:958177/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:987295/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:998930/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:256235/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:107685/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:1107231/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:1199383/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:1201073/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:148214/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:149936/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:164146/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:201222/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:237400/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:253021/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:254622/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:1032003/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:287423/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:288401/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:311242/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:333020/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:35790/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:438186/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:463795/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:478888/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:48241/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACAGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:378504/1‑60 (MQ=255) cgcgcgAGGAAGTGTTTGCCGATCGAGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGaa  >  1:336645/1‑60 (MQ=255)                                                            | CGCGCGAGGAAGTGTTTGCCGATCGCGGTTATCAGGCTGACGGCTCGCTGGTGCCGCGAA  >  minE/458156‑458215

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑