Missing coverage evidence...
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CTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGC  >  minE/474181‑474240                                                            | ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGTATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:1164528/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:534195/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:958292/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:896435/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:893724/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:699631/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:698592/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:640796/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:634819/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:610172/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:606435/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:578777/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:554259/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:1004092/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:503465/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:498852/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:469275/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:445769/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:385549/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:327920/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:249794/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:1177839/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:1140229/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:1085854/60‑1 (MQ=255) ctctATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:1080285/60‑1 (MQ=255)              ggCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:900447/47‑1 (MQ=255)                         cGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGc  <  1:708026/36‑1 (MQ=255)                                                            | CTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGC  >  minE/474181‑474240

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑