Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	11199	11295	97	31 [0]	[0] 2	yaaW htgA	conserved hypothetical protein hypothetical protein

CAAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCT  >  minE/11137‑11198                                                              | caAGATGCTG‑AATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:880750/1‑61 (MQ=255) caAAATTCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:578719/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGTGATGCCCt  >  1:1116127/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:455451/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:990553/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:915758/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:766073/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:74171/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:712275/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:703317/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:690796/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:679411/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:655485/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:560267/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:544806/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:482515/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:1024809/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:436261/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:416540/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:408000/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:374468/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:325892/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:274384/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:173838/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:146442/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:1101801/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:1089301/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:1070405/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:1070067/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:1050129/1‑62 (MQ=255) caAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGAGATGTTGCTCGGGATGCCCt  >  1:806805/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAAAATGCTGTAATTCTCCGGCAATCAGCTGCCAGTTGCGGCGATGTTGCTCGGGATGCCCT  >  minE/11137‑11198

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑