Missing coverage evidence...
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TTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGC  >  minE/518014‑518074                                                             | ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:689233/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:3672/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:37880/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:404587/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:429524/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:441253/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:463743/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:471851/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:537375/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:55185/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:555884/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:685401/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:356659/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:723015/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:723182/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:733572/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:743134/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:746613/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:76212/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:762534/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:817887/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:849721/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:891880/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:936291/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:150511/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1031328/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1050314/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1107210/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1121626/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1146176/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1158934/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1179437/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1183409/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1184180/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1191497/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:11945/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:1018237/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:178278/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:18853/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:234399/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:255184/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:256644/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:256667/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:25964/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:283249/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:284583/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:351545/1‑61 (MQ=255) ttGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGc  >  1:354908/1‑61 (MQ=255)                                                             | TTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGC  >  minE/518014‑518074

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑