Missing coverage evidence...
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TCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCGAGA  >  minE/529186‑529247                                                              | tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATGGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:316701/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:623397/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:446293/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:467220/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:487375/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:499557/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:546489/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:547892/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:554754/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:567792/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:580793/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:620093/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:372062/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:626594/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:628389/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:733173/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:755601/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:767088/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:822846/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:852138/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:875564/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:952156/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:970536/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:167650/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1010682/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1010954/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1014998/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1019438/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1130928/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1162256/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1164609/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1172852/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:126611/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:131900/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:1001280/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:175495/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:188575/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:220728/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:269896/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:276115/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:286095/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:314998/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:315326/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:347111/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGATTCgaga  >  1:875466/1‑62 (MQ=255) tCAGATTATCGAGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCgaga  >  1:23215/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCAGATTATCGCGCAGCGTCTGGTTAAAATGACGATCGTGGATGATGACATTTGCTTCGAGA  >  minE/529186‑529247

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑