Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	544115	544265	151	77 [0]	[0] 8	mntR	transcriptional regulator of mntH

CACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCA  >  minE/544053‑544114                                                              | cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTTGTCGCGCa  >  1:668261/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:64254/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:773103/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:769877/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:741124/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:709402/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:705300/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:684675/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:681729/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:674461/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:787120/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:623806/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:623753/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:598781/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:589851/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:557549/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:555728/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:553097/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:521068/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:471229/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:88081/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:997245/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:991755/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:961261/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:938700/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:921645/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:903660/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:902902/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:898281/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:885964/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:461716/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:866687/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:848601/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:838892/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:834160/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:832965/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:821112/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:813179/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:802646/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1121099/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:160897/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:151261/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1193516/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:118751/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1174461/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:11616/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1148398/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1138913/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1123440/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:168021/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1104328/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1074454/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:105673/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1046878/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1045732/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1023653/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1018318/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:101045/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:260617/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:454874/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:454131/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:427617/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:41364/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:365426/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:363815/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:356032/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:343324/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:290923/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:1006082/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:259821/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:249235/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:247522/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:246016/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:226176/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:21873/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:190031/1‑62 (MQ=255) cACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAAAGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCa  >  1:194015/1‑62 (MQ=255)                                                              | CACGAAATGAGAACGCTATGTATGCGTCACCATAATGAGGAAGCACAATGAGTCGTCGCGCA  >  minE/544053‑544114

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑