Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	579144	579206	63	57 [0]	[0] 22	cspD	cold shock protein homolog

ACTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAC  >  minE/579084‑579143                                                            | aCTTCGACTGGCACAATAAGACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:599424/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:642231/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:358009/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:358293/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:893547/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:892480/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:456640/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:457580/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:46937/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:55094/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:566021/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:600481/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:607986/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:920095/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:646883/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:665178/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:672268/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:677676/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:717665/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:876632/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:857608/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:74469/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:799850/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:804573/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:826800/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:168065/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1027377/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1068272/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1081147/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1086816/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1098407/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1120922/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1137688/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1155163/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:1156365/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:128422/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:134497/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:17889/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:197046/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:200920/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:212819/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:231183/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:259796/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:292772/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:293626/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:298401/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:301648/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:97451/60‑1 (MQ=255) aCTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTCGTGGACATCAAAc  <  1:1039369/60‑1 (MQ=255)  cTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:72540/59‑1 (MQ=255)  cTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:375882/59‑1 (MQ=255)  cTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:909838/59‑1 (MQ=255)  cTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:344570/59‑1 (MQ=255)              caATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:345990/47‑1 (MQ=255)               aaTAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:387563/46‑1 (MQ=255)                  aaCACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:72365/43‑1 (MQ=255)                         gCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAc  <  1:938011/36‑1 (MQ=255)                                                            | ACTTCGACGGGCACAATAACACTGGCGTGATTGCCTTTTGGCCCCTGGTGGACATCAAAC  >  minE/579084‑579143

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑