Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	579751	579796	46	75 [0]	[0] 31	clpS	regulatory protein for ClpA substrate specificity

ATATTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACGTGT  >  minE/579702‑579750                                                 | atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACttgt  >  1:357699/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:541356/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:667744/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:644882/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:592384/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:59055/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:580884/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:571635/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:566693/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:562639/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:548535/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:701992/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:532437/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:526049/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:525827/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:439717/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:434507/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:410153/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:407363/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:870524/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:994790/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:989987/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:974803/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:957258/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:952828/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:926454/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:921808/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:886351/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:872644/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:393677/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:857733/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:848853/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:83446/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:832444/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:789978/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:785394/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:717886/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:711980/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1104060/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:199317/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:196125/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:193127/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:146500/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:141945/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1200049/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1171554/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1159023/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1148726/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:213620/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1087714/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1085442/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1064369/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1057359/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1030475/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1020825/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1019676/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1012480/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:313596/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:391650/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:388980/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:374486/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:369816/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:36888/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:358727/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:356394/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:32155/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:1011064/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:311839/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:304858/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:276604/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:251933/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:23862/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:231720/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACgtgt  >  1:215306/1‑49 (MQ=255) atatTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGATATTGACgtgt  >  1:675410/1‑49 (MQ=255)                                                 | ATATTAGTCAATGATGATTACACTCCGATGGAGTTTGTTATTGACGTGT  >  minE/579702‑579750

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑