Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	595683	595908	226	48 [0]	[0] 26	ycaJ	recombination protein

CGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAA  >  minE/595621‑595682                                                              | cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:696280/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:410655/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:429489/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:494493/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:517979/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:544012/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:545350/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:566034/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:568841/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:633358/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:648265/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:686754/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:36391/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:699500/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:703450/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:705441/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:75439/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:784397/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:825960/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:842174/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:848594/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:906071/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:948986/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:990350/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:203713/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:108766/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:1087799/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:1137265/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:114114/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:1159509/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:1159525/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:1165017/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:1177783/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:126869/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:130186/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:172173/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:1047744/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:205521/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:207646/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:223214/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:261795/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:270282/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:27474/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:310924/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:324789/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:328686/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:331039/1‑62 (MQ=255) cGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGaa  >  1:332611/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGATGCAGGTGGCAATTGCGGCCTGGGATTGCTTTACTCGCGTTGGCCCGGCGGAAGGTGAA  >  minE/595621‑595682

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑