Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	661645	661648	4	16 [0]	[0] 5	pyrD	dihydro‑orotate oxidase, FMN‑linked

GCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTC  >  minE/661583‑661644                                                              | gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:1163634/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:124716/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:177617/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:239617/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:343759/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:413057/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:492926/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:502187/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:592818/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:730033/62‑1 (MQ=255) gCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTAAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:1070275/62‑1 (MQ=255)  cAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:386374/61‑1 (MQ=255)  cAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:43643/61‑1 (MQ=255)  cAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:469757/61‑1 (MQ=255)  cAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:584968/61‑1 (MQ=255)   aGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTc  <  1:724228/60‑1 (MQ=255)                                                              | GCAGAAAGTGCCTGCGAAACCTGTTAACTGCATGGGCCTGACGTTTAAAAATCCGCTTGGTC  >  minE/661583‑661644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑