Missing coverage evidence...
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AAGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAT  >  minE/675418‑675479                                                              | aaGCGCCATTTTAATGCGTAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:466057/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGTAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:562383/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACTCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1190054/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:814600/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:487876/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:492439/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:494539/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:523874/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:547281/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:603437/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:741078/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:796279/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:47129/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:839875/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:861946/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:872889/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:901891/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:904533/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:915632/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:94882/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:97873/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:994844/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:189884/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1051973/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1096770/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1138789/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1156383/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1181733/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1190267/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:120549/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:132444/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:18287/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:487696/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:19712/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:253464/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:26334/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:267046/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:383626/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:391290/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:425044/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:459408/1‑62 (MQ=255) aaGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAt  >  1:1026051/1‑62 (MQ=255)                                                              | AAGCGCCATTTTAATGCGGAACACCAGCATACGCGCAAAAAATCGATCGATCTGGAATTTAT  >  minE/675418‑675479

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑