Missing coverage evidence...
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ATCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGA  >  minE/714295‑714356                                                              | aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCTGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:938159/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:912614/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:663676/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:700893/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:716400/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:756890/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:803496/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:855039/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:864705/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:89810/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:912235/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:651798/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:916329/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:918250/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:934466/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:9465/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:966171/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:966769/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:987102/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:992790/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:246989/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:1128846/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:1138032/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:1139231/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:1188546/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:122416/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:176461/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:187146/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:1126526/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:259317/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:325294/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:446241/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:489755/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:53026/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:57071/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:583293/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:59965/62‑1 (MQ=255) aTCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:619879/62‑1 (MQ=255)          gcgGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:223361/53‑1 (MQ=255)                  gCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGa  <  1:209836/45‑1 (MQ=255)                                                              | ATCAGCAACGCGGCTTGGCCAGTTAATTCCGGCTACCAGCGTCAGATTACGCAGTAGCGGGA  >  minE/714295‑714356

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑