Missing coverage evidence...
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AAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAC  >  minE/717456‑717517                                                              | aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGTTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:1044506/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:1023219/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:496786/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:555291/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:558298/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:587243/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:636979/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:700705/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:709062/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:71461/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:729684/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:746018/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:756640/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:769773/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:769906/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:818803/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:849973/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:913363/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:922265/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:941118/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:952324/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:971973/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:447561/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:1053888/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:1071023/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:1076695/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:1162422/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:140156/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:196429/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:218098/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:22078/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:233769/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:241880/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:27081/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:277222/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:301021/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:387790/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:392443/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:392639/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:40508/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:417831/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:4308/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:466535/62‑1 (MQ=255) aaaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGGTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:691887/62‑1 (MQ=255)  aaCGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAc  <  1:979034/61‑1 (MQ=255)                          ttttCTGTGGTGAGGTTGAAGATCATCCGGCGGTGAc  <  1:869070/37‑1 (MQ=38)                                                              | AAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGAC  >  minE/717456‑717517

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑