Missing coverage evidence...
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TAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGC  >  minE/725320‑725381                                                              | tAGCGGTAAAGCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1139560/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGGGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:842196/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:79156/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1005912/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:442746/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:53678/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:5381/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:68070/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:689030/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:702606/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:717668/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:718984/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:381505/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:851914/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:853518/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:865136/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:868344/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:894779/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:983318/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:984238/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1248/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1007139/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1094670/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1153096/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1153114/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1168177/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1199144/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1203117/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:366597/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:125374/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:125740/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:130929/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:188666/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:225802/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:262368/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:269446/62‑1 (MQ=255) tAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:283363/62‑1 (MQ=255)  aGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:825539/61‑1 (MQ=255)     ggTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:123952/58‑1 (MQ=255)     ggTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:1194299/58‑1 (MQ=255)            caaccaGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:387369/51‑1 (MQ=255)                            aTCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGc  <  1:404489/35‑1 (MQ=255)                                                              | TAGCGGTAAACCAACCAGCGTGTTAGGATCACGCCCCTCTAAACGCTCAAACAGCGTAATGC  >  minE/725320‑725381

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑