Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	768068	768369	302	34 [0]	[0] 2	phoQ	sensory histidine kinase in two‑compoent regulatory system with PhoP

CGGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCA  >  minE/768028‑768067                                        | cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:731172/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:511156/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:634219/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:682407/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:692931/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:713699/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:715057/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:720311/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:726426/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:509112/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:7397/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:750953/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:872720/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:884568/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:922660/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:933750/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:935981/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:151449/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:1028418/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:104105/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:111453/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:1134548/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:11523/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:1177494/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:1181364/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:12297/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:1005133/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:222073/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:223082/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:264073/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:268836/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:411507/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:426800/1‑40 (MQ=255) cgGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCa  >  1:461679/1‑40 (MQ=255)                                        | CGGCTGAGCAATGTCCCGCCGCGCATACTGGCACGATGCA  >  minE/768028‑768067

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑