Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	781534	781631	98	39 [0]	[0] 24	ycgN/hlyE	conserved hypothetical protein/hemolysin E

CCTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCT  >  minE/781473‑781533                                                             | ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:648422/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:532248/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:539296/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:552585/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:555976/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:562434/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:59588/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:608908/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:635058/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:641618/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:514494/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:652660/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:741728/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:817228/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:833907/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:928681/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:977533/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:983562/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:988139/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:995650/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:183912/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:1073524/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:112069/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:1123365/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:1140235/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:1194962/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:129505/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:134216/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:135099/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:156781/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:1059491/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:271018/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:29393/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:302684/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:307385/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:343059/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:437019/61‑1 (MQ=255) ccTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:501851/61‑1 (MQ=255)  cTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCt  <  1:430847/60‑1 (MQ=255)                                                             | CCTGACTGGGCGCAGTGATAAATTTAATAGATGCTGATGGGGGCTTTCTTAATATACGTCT  >  minE/781473‑781533

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑