Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	795445	795718	274	44 [0]	[0] 11	emtA	lytic murein endotransglycosylase E

GGATAGAAGAAGTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTTCA  >  minE/795383‑795444                                                              | atctAGAAGAAGTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:780237/59‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGGGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:63304/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATTGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:101455/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:400375/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:984985/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:4313/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:434428/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:443402/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:463921/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:561894/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:576664/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:582598/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:621633/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:65158/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:70044/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:709117/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:714835/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:786090/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:813579/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:863001/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:897486/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:924968/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:165597/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1041442/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1109321/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1131689/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1136802/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1159164/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1177447/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1180746/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1188718/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:134001/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:166938/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:190142/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:232256/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:234023/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:242839/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:249230/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:292042/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:310613/55‑1 (MQ=255)        agaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:393526/55‑1 (MQ=255)         gaagTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:145057/54‑1 (MQ=255)            gTGAAATTGAGATGGGTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:1007648/51‑1 (MQ=255)               aaaTTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTtca  <  1:36072/48‑1 (MQ=255)                                                              | GGATAGAAGAAGTGAAATTGAGATGGTTTGCCTTTTTGATTGTGTTATTAGCGGGTTGTTCA  >  minE/795383‑795444

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑