Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	797847	797856	10	77 [0]	[0] 21	ycgY/treA	hypothetical protein/periplasmic trehalase

CGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAC  >  minE/797786‑797846                                                             | cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTgacgac  <  1:445760/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:622595/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:739521/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:729806/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:728822/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:711278/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:693560/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:671291/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:656775/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:636108/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:625491/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:766458/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:606242/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:581529/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:570255/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:555007/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:545419/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:54332/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:529655/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:509524/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:885575/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:989284/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:979553/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:974837/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:963349/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:952367/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:946431/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:945479/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:927569/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:91254/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:509106/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:874863/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:858985/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:831150/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:831008/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:81313/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:793149/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:776561/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:768800/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1152025/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1011358/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:246561/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:221158/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:195952/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:153299/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:145645/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:134183/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1199371/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:259069/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1124821/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1120434/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1109013/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1099398/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1084759/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1073251/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1025863/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1024968/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:271949/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:455987/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:4450/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:444259/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:441758/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:441365/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:439830/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:406126/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:40599/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:392232/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:339831/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:328589/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:321120/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:299644/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:2872/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:263940/61‑1 (MQ=255) cGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTATGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:1161839/61‑1 (MQ=255)    cAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:447445/58‑1 (MQ=255)          ttGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:42090/52‑1 (MQ=255)                     tCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAc  <  1:783954/41‑1 (MQ=255)                                                             | CGCCAGGACTTGAAAAACCGTCTGTGTAGAAAAAACCATAGCTATGGTGTTATCTGCCGAC  >  minE/797786‑797846

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑