Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 806544 806604 61 65 [0] [0] 8 ycgV predicted adhesin

AATACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGCC  >  minE/806482‑806543
                                                             |
aaTTCGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:719514/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGCTTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1187588/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:681907/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:408653/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:46941/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:100122/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:503676/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:526642/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:53786/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:595289/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:631513/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:638871/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:641700/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:658974/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:674332/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:677399/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:494117/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:687316/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:711438/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:722544/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:783953/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:811075/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:812487/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:856940/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:859923/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:892112/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:900680/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:9307/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:993264/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:217477/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1113995/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1117070/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1120082/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1087365/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1131822/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1080471/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1161634/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:123026/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:174128/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:193138/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:106363/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1054710/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:338389/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:347832/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1018757/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:352218/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:375266/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:383083/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:397921/62‑1 (MQ=255)
aaTACGTGATTACCAGAACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:811501/62‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:866537/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1012429/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:878273/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1109965/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:796061/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:781702/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1129120/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:714693/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:221460/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:253648/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:296933/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:562850/61‑1 (MQ=255)
 aTACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:423676/61‑1 (MQ=255)
                  ctactCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:510756/44‑1 (MQ=255)
                           cTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGcc  <  1:1133084/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
AATACGTGATTACCAGCACTACTCCCGCTGATATTCAATAAATCCCCTTTATTATTAACGCC  >  minE/806482‑806543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: