Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	828326	828396	71	47 [0]	[0] 14	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

AGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATC  >  minE/828264‑828325                                                              | aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:742129/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:1036205/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:516714/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:544696/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:55123/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:56728/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:574690/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:601079/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:62262/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:698566/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:722126/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:514345/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:778484/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:782161/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:815879/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:87093/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:90572/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:927568/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:932506/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:967723/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:988083/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:994274/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:178713/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:1042838/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:1106259/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:1112171/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:1159593/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:1166891/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:1199507/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:127228/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:132686/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:148671/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:151971/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:155317/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:514211/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:197953/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:204059/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:308980/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:313429/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:342925/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:389260/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:446793/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCAGCGATc  <  1:414366/62‑1 (MQ=255) aGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGGCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:562263/62‑1 (MQ=255)  gCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:182888/61‑1 (MQ=255)  gCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:537605/61‑1 (MQ=255)              aCTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATc  <  1:745763/49‑1 (MQ=255)                                                              | AGCAAAATACCGTACTGCGTATGAGAGTCAGCCAGCCGCCACTTCAGGGTCGTGCCGCGATC  >  minE/828264‑828325

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑