Missing coverage evidence...
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CCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACC  >  minE/875523‑875583                                                             | ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACTGAcc  <  1:38296/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:667574/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:419385/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:422234/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:438728/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:442819/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:45146/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:473633/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:474602/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:498017/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:503625/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:505771/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:655469/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:971331/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:691563/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:711459/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:757615/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:7758/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:835550/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:841021/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:85865/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:860072/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:91502/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:935079/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1010687/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:156438/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1017777/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1057922/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:108386/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1097391/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1118874/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1124368/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1166270/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:1166808/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:134085/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:350578/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:164479/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:176511/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:223449/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:246528/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:247874/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:253337/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:262310/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:304619/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:308661/61‑1 (MQ=255) ccGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:330672/61‑1 (MQ=255)  cGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:740844/60‑1 (MQ=255)        tAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:151583/54‑1 (MQ=255)                 tCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGAcc  <  1:307341/45‑1 (MQ=255)                                                             | CCGGATGTAGTGGGCTTCAAACTTACCGGAAAATTACGTGAAGGTATTACCGCCACAGACC  >  minE/875523‑875583

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑