Missing coverage evidence...
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TACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACCG  >  minE/904372‑904432                                                             | tACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:737063/61‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:397745/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:360730/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:401585/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:435615/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:452088/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:454826/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:46187/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:497309/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:498721/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:54374/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:593811/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:642482/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:760104/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:779446/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:79382/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:796482/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:826162/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:852447/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:862035/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:86820/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:873507/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:980641/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1178959/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:103136/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1085285/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1104381/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1108783/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1110611/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1115032/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1118957/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1119738/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1132865/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1156557/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1177791/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1029870/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:1184304/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:177493/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:239521/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:263710/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:299344/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:323289/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:323882/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:32858/60‑1 (MQ=255)  acacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:353550/60‑1 (MQ=255)   cacGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:293528/59‑1 (MQ=255)                    ctGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACcg  <  1:625681/42‑1 (MQ=255)                                                             | TACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGCTTTTCAAAATCATCACCG  >  minE/904372‑904432

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑