Missing coverage evidence...
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TTGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTGCGC  >  minE/918404‑918465                                                              | ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:105344/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:1068861/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:1135438/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:1136847/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:1202876/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:499412/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:516186/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:58535/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:670344/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:682355/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:825458/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:874054/62‑1 (MQ=255) ttGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTgcgc  <  1:943763/62‑1 (MQ=255)                                                              | TTGCAGAAATTCAGCGTTACGGAAAGTGGAGAGGGTGATAACGTTGTTCAGACCTTCTGCGC  >  minE/918404‑918465

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑