Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	944590	944758	169	55 [0]	[1] 2	ddpC	D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

AGCCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCA  >  minE/944528‑944589                                                              | agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:722490/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:398246/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:400374/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:402774/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:487859/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:493282/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:503974/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:527594/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:568200/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:593628/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:601323/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:602137/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:605300/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:615210/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:374517/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:730738/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:749622/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:767748/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:789289/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:821751/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:827767/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:857905/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:860541/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:863567/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:921395/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:94608/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:99935/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:37174/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1011229/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1014832/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1065489/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1071571/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1089745/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1090159/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1104741/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1119625/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1149606/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:115196/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:1195965/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:124791/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:128198/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:148335/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:15317/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:154265/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:184465/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:187121/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:251902/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:303367/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:307167/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:334006/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:360789/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:364603/62‑1 (MQ=255) agcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:100690/62‑1 (MQ=255)  gcCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:616978/61‑1 (MQ=255)                          ggCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCa  <  1:359730/37‑1 (MQ=255)                                                              | AGCCAGCATGGCGTTAAACAAACTCGGCCCGAGAGCGGCAGCCAGTGCCATTGTCAGTACCA  >  minE/944528‑944589

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑