Missing coverage evidence...
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CTGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCTT  >  minE/950845‑950906                                                              | ctGCATCCTTGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:556251/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACTCGGTTTCTACCTCGtttt  <  1:304498/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:974580/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:105392/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:966967/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:927042/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:923290/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:875488/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:846057/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:844227/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:786032/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:784533/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:719062/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:708687/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:599393/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:57819/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:507354/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:501916/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:488004/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:378954/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:375293/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:348590/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:339532/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:316090/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:233566/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:129783/62‑1 (MQ=255) ctGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCtt  <  1:1141389/62‑1 (MQ=255)                                                              | CTGCATCCTGGCGCATCTAAAGACTGGCTTTCCAGAGTTCAACACGGTTTCTACCTCGTCTT  >  minE/950845‑950906

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑