Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1000947	1001055	109	6 [0]	[0] 15	mdtJ	multidrug efflux system transporter

TTTATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACT  >  minE/1000885‑1000946                                                              | tttATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACt  >  1:1035112/1‑62 (MQ=255) tttATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACt  >  1:1104180/1‑62 (MQ=255) tttATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACt  >  1:1138298/1‑62 (MQ=255) tttATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACt  >  1:165551/1‑62 (MQ=255) tttATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACt  >  1:995700/1‑62 (MQ=255) tttATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACt  >  1:997017/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTTATCAACACAATCCCGGCGACCAGGGTGGTTAACCCGGCAATTTTCATCAGCGATAAACT  >  minE/1000885‑1000946

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑