Missing coverage evidence...
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GGAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCAA  >  minE/1043801‑1043862                                                              | ggAAGGTTGGAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:760316/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:474276/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:951417/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:88244/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:878960/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:624198/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:610500/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:591094/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:547650/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:524932/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:483587/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:450828/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:436056/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:405720/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:354725/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:288451/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:183378/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:16244/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:1198975/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:1118647/62‑1 (MQ=255) ggAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGAGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:1067647/62‑1 (MQ=255)  gtaGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCaa  <  1:1158744/59‑1 (MQ=255)                                                              | GGAAGGTTGCAGTTCAGAATCGACCAGTGCCTGCATCAGGTCTGCGCCCTTTTCCATCTCAA  >  minE/1043801‑1043862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑