Missing coverage evidence...
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TCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCCGTCGT  >  minE/1087874‑1087935                                                              | tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGCCCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:63126/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGCCCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:623266/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGCCCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:1002009/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:392341/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:980766/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:866885/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:816388/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:703304/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:639068/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:605585/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:554791/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:408151/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:380995/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:370463/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:352912/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:165238/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:148440/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:1191943/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:1183098/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:1161830/1‑62 (MQ=255) tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCcgtcgt  >  1:1023076/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCCGTCGT  >  minE/1087874‑1087935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑