Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1101666	1101815	150	52 [0]	[0] 4	ydiB	quinate/shikimate 5‑dehydrogenase, NAD(P)‑binding

TCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATGCGC  >  minE/1101604‑1101665                                                              | tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTTGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:510834/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:70342/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:1003154/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:449279/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:491452/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:504949/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:518936/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:609074/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:61434/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:649041/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:676941/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:686275/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:699111/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:433697/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:865156/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:909774/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:922121/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:928090/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:931617/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:940947/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:946085/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:954932/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:960009/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:961641/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:962986/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:293450/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:1006821/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:1061535/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:1117127/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:1145350/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:179610/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:18253/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:212472/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:228515/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:232937/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:290371/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:432773/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:313289/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:321315/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:356852/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:364573/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:369965/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:372123/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:387732/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:391424/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:414994/62‑1 (MQ=255) tCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAACTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:403476/62‑1 (MQ=255)  cGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAATGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:574970/61‑1 (MQ=255)  cGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:342534/61‑1 (MQ=255)  cGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:268273/61‑1 (MQ=255)  cGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:23421/61‑1 (MQ=255)   gAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCATTTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATgcgc  <  1:748530/60‑1 (MQ=255)                                                              | TCGAAGTGGATAACGATAGCTTTCCTGGAGCAATTGAAGGATTAAAAGCCCTCAAAATGCGC  >  minE/1101604‑1101665

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑