Missing coverage evidence...
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AATAAGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAC  >  minE/1145243‑1145304                                                              | aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:467349/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:992949/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:985674/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:962463/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:897481/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:856901/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:829745/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:637017/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:634441/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:631024/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:628393/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:614417/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:611850/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:561253/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:544816/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:510825/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:431616/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:1043152/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:1098869/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:1133121/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:1149999/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:1178009/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:14355/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:173291/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:338235/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:353014/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:401988/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:409481/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:410142/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:411547/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:1012005/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGCTGTGCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:303784/1‑62 (MQ=255) aataaGCCCCACCGCGATGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAc  >  1:844477/1‑62 (MQ=255)                                                              | AATAAGCCCCACCGCGCTGTTCCAGTTCTTTCGGCTTAACTTTCAGCTCAGGATTTTTATAC  >  minE/1145243‑1145304

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑