Missing coverage evidence...
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CCCCATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCGAGA  >  minE/1147428‑1147488                                                             | ccccATCCCCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:755975/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:579961/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1010786/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:379244/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:384057/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:387984/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:418080/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:436366/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:50172/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:50206/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:55712/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:377794/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:599964/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:664650/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:681625/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:720253/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:86796/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:900628/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:917852/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:997336/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:30916/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1021840/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1036841/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1045042/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1047849/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1087044/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1116545/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1160088/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:117496/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1176415/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1177784/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1192836/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1201806/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:124034/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:125160/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:183458/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:307290/61‑1 (MQ=255) ccccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:352474/61‑1 (MQ=255)  cccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:505407/60‑1 (MQ=255)  cccATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:433288/60‑1 (MQ=255)      tCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTACTTTTGCGTATCGGGAATGTTATCgaga  <  1:1020623/56‑1 (MQ=255)                                                             | CCCCATCACCACTTCTTCCAGCTCTTCAGCTTCCGTTTGCGTATCGGGAATGTTATCGAGA  >  minE/1147428‑1147488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑