Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1174453	1174526	74	51 [0]	[0] 13	topB	DNA topoisomerase III

GACGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCG  >  minE/1174391‑1174452                                                              | gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:603937/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1000155/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:375324/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:377082/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:424325/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:48348/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:493379/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:498107/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:522827/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:583804/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:588375/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:596195/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:348890/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:649926/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:726245/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:730713/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:759881/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:760175/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:815436/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:86589/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:950379/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:973743/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:986185/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:99333/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:335628/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1036389/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1086255/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1110423/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1125718/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1158095/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:116683/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1190901/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:134418/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:148523/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:150478/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:157159/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:232518/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:232538/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:237144/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:238400/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:249121/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:288288/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:296738/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:298291/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:342969/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGAAAATCg  <  1:500512/62‑1 (MQ=255) gaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGGCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:359990/62‑1 (MQ=255)  aCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:569812/61‑1 (MQ=255)  aCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:331157/61‑1 (MQ=255)                     cGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:153600/42‑1 (MQ=255)                      ggAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCg  <  1:1019525/41‑1 (MQ=255)                                                              | GACGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCACTTTTCCGGGACAATCG  >  minE/1174391‑1174452

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑