Missing coverage evidence...
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CGCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTC  >  minE/1174573‑1174633                                                             | cGCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:442292/61‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:770617/60‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:643561/60‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:663848/60‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:673080/60‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:679749/60‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:690691/60‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:711915/60‑1 (MQ=255)  gCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTc  <  1:726534/60‑1 (MQ=255) 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                                                            | CGCCTTTCCGGTGCGGTTTGGGCAGGACATCAGCAATGGCGCGCGCCAGACTCGGTTTTTC  >  minE/1174573‑1174633

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑