Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1177743	1177767	25	51 [0]	[0] 10	sppA	protease IV

TCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGC  >  minE/1177682‑1177742                                                             | tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:695750/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:434760/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:447146/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:453527/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:460644/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:54844/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:557690/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:560526/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:56812/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:5867/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:613578/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:667881/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:688074/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:402608/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:703407/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:769978/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:78387/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:870854/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:893594/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:938139/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:943835/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:950797/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:970941/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:973274/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:976403/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:979105/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:271685/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1013908/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1036548/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1060709/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1128241/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1128933/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1130823/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1167100/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1400/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:167452/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:211849/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:1010622/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:275048/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:291429/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:296356/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:30805/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:308489/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:342109/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:3441/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:361197/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:375217/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:384665/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:3999/61‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCCGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:261905/61‑1 (MQ=255)                           cAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGggcggc  <  1:22671/35‑1 (MQ=255)                                                             | TCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGC  >  minE/1177682‑1177742

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑