Missing coverage evidence...
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GTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCT  >  minE/1189955‑1190016                                                              | gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:458372/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:98799/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:97978/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:943214/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:829653/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:80557/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:805058/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:70846/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:674389/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:648046/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:645472/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:584201/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:524115/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:505008/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:428848/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:382252/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:377449/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:369721/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:354176/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:223417/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:184706/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:124434/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:1184050/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:1112929/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:1084012/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:106226/62‑1 (MQ=255) gTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:1061270/62‑1 (MQ=255)                    atTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCt  <  1:1006321/43‑1 (MQ=255)                                                              | GTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCT  >  minE/1189955‑1190016

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑