Missing coverage evidence...
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AACTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAC  >  minE/1194323‑1194384                                                              | accTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:683528/60‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:642900/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:982852/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:950748/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:915360/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:91028/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:880944/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:844084/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:806958/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:766157/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:747225/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:7413/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:726579/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:710480/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:699362/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:687748/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:342079/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:113965/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:1160391/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:1162212/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:178360/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:256244/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:271710/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:306162/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:1127948/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:447349/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:448815/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:472022/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:500913/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:574175/62‑1 (MQ=255) aaCTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:633485/62‑1 (MQ=255)      aaTCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:333883/57‑1 (MQ=255)               gcggcgTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAc  <  1:690733/48‑1 (MQ=255)                                                              | AACTAAATCTTGTTGCGGCGTGGGACTGCTGCCTTTAATGGCGTCCGGCACAGTGACACAAC  >  minE/1194323‑1194384

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑