Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1206325	1206425	101	36 [0]	[0] 15	manX	fused mannose‑specific PTS enzyme IIAB components

AACGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGAAA  >  minE/1206263‑1206324                                                              | aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGTCCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:633332/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:743178/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:1040300/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:576441/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:583469/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:585303/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:636124/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:736965/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:738112/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:554184/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:746980/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:81537/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:834665/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:839811/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:850120/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:87698/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:884459/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:975775/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:504724/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:1116322/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:1123378/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:1127737/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:1187328/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:1189787/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:159563/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:172837/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:226232/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:252175/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:274931/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:368304/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:414532/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:481293/62‑1 (MQ=255) aaCGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:535472/62‑1 (MQ=255)           gCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:705263/52‑1 (MQ=255)           gCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:1078405/52‑1 (MQ=255)                       gaCCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGaaa  <  1:387804/40‑1 (MQ=255)                                                              | AACGTTAATGGCCCGTGATGATGACCCAAGCTTTGATGAACTGGTGGCACTGGCAGTAGAAA  >  minE/1206263‑1206324

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑