Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1206611	1206685	75	33 [1]	[0] 4	manX	fused mannose‑specific PTS enzyme IIAB components

ATGAAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGTAACAGC  >  minE/1206550‑1206616                                                             |       atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:898227/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:565302/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:570213/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:612913/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:722926/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:795035/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:817789/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:844248/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:875083/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:562615/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:927115/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:928525/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:936557/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:943492/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:978296/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:981791/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:990664/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:1073570/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:539216/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:4777/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:413670/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:412745/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:402803/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:367457/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:356884/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:283307/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:211517/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:171039/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:168459/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:1178749/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:1177161/1‑61 (MQ=255) atgaAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGt        >  1:1175228/1‑61 (MQ=255)      gTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGTAACAGc  <  1:445864/62‑1 (MQ=255)                                                             |       ATGAAGTGGCTGCGGATACCGTTCGTAAGACACTGCTCACCCAGGTTGCACCTCCGGGCGTAACAGC  >  minE/1206550‑1206616

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑